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Equipos de colecciones biológicas UCH se capacitan en plataforma global de datos abiertos

Equipos de colecciones biológicas UCH

Actualmente la Universidad de Chile cuenta con 35 colecciones biológicas y más de 340 mil especímenes, siendo una de las instituciones con mayor número de colecciones en el país. Buscando resguardar y valorar cada una de ellas, durante el año 2020 se impulsó la creación del Comité de Diversidad Biológica.

Federico Luebert, académico integrante del CDB y curador del Herbario de la Facultad de Ciencias Agronómicas (AGUCH).
Federico Luebert, académico integrante del CDB y curador del Herbario de la Facultad de Ciencias Agronómicas (AGUCH).

Este 10 y 11 de mayo se llevó a cabo el taller "Gestión y publicación de datos abiertos de biodiversidad en la plataforma GBIF". El espacio de capacitación, dirigido a curadores, curadoras, estudiantes y funcionarios de la Casa de Bello, fue impulsado por la Vicerrectoría de Investigación y Desarrollo (VID) a través del Comité de Diversidad Biológica (CDB) y contó con la colaboración del proyecto InES Ciencia Abierta.

Durante el 2020, la consultora Nonken registró siete colecciones biológicas con más de 180 mil ejemplares dentro de la Universidad de Chile. Ese mismo año, la VID conformó el Comité de Diversidad Biológica con el fin de crear políticas, estándares y acciones institucionales en la materia, entre las cuales, se destacó la realización del primer catastro oficial durante 2022. Con 340 mil ejemplares  y 35 colecciones, el estudio posicionó a la UCH como la institución con más especímenes a nivel nacional.

Bajo este contexto y dentro de las acciones del CDB, el pasado miércoles y jueves se realizó de manera presencial el taller "Gestión y publicación de datos abiertos de biodiversidad en la plataforma GBIF". La Global Biodiversity Information Facility (GBIF) es un sistema internacional de datos que entrega acceso abierto a información sobre todas las formas de vida en la Tierra a cualquier persona en cualquier lugar del mundo.

En este sentido, la actividad se impulsó con el fin de entregar herramientas a las y los curadores de colecciones biológicas y estudiantes, que les permitan aumentar el volumen de registro de datos sobre las colecciones biológicas de la Universidad de Chile en GBIF.

El académico integrante del CDB y curador del Herbario de la Facultad de Ciencias Agronómicas (AGUCH), Federico Luebert, destacó la iniciativa y enfatizó en la importancia de visibilizar y generar conciencia en la comunidad sobre el valor de estas colecciones para la investigación, la docencia y la extensión.

“Las iniciativas de este tipo son fundamentales porque van a permitir que la Universidad incremente su volumen de datos en su perfil institucional en GBIF y porque van a posibilitar que muchas colecciones realmente puedan subir sus datos, porque uno de los grandes obstáculos que hay es que no se sabe cómo operar con las bases de datos para poder hacerlas disponibles a través de GBIF”, finalizó Luebert.

Por su parte, la ingeniera forestal UCH y encargada de dictar el taller, Antonia Serey, explicó la necesidad de comprometerse a publicar estos datos, visibilizarlos y relevarlos para poder tomar decisiones que permitan proteger la biodiversidad.

Ojalá sigan dándose estas instancias de capacitaciones para que todas las personas que están trabajando puedan hacerlo de forma óptima. (...) Como no siempre se mantienen las mismas personas trabajando con las bases de datos o como curadores de las especies, es un conocimiento que hay que transmitir”, agregó la ingeniera forestal.

La biodiversidad como parte de la Ciencia Abierta

En vinculación con la Estrategia Nacional de Biodiversidad 2017-2030 del Ministerio de Medio Ambiente, el CDB ha comenzado diversas acciones dentro de la universidad para coordinar institucionalmente el trabajo que realizan las especies. En esta misma línea, el Comité, con el apoyo del proyecto InES Ciencia Abierta UCH, creó la convocatoria “Apoyo a la publicación de datos abiertos en GBIF UCH Colecciones Biológicas”.

Las postulaciones a esta iniciativa en la que se enmarca el taller realizado entre el 10 y 11 de mayo, se realizaron en marzo de este año y en ellas se seleccionó a 10 colecciones biológicas de la Universidad de Chile que requerían apoyo para procesar y publicar sus datos en la plataforma GBIF. De esta manera, por medio del financiamiento a estudiantes, tesistas o practicantes que colaboren en esta labor dentro de las colecciones, se estima que los registros bajo el perfil de la Casa de Bello en este sistema global de datos de biodiversidad suban a alrededor de siete mil.

"Las Colecciones Biológicas son un aporte comprobado al conocimiento científico sobre las distintas especies y a la preservación”, afirmó Camilo Godoy, asistente de coordinación del InES Ciencia Abierta. A ello agregó que “GBIF permite una vinculación con bases de datos internacionales abiertas. Este es uno de los objetivos del proyecto de Ciencia Abierta en nuestra Universidad: fomentar comunidades disciplinarias e interdisciplinarias de académicos y académicas en torno a los principios de ciencia abierta y diversidad biológica"

Es por ello que, el taller "Gestión y publicación de datos abiertos de biodiversidad en la plataforma GBIF" abordó elementos tanto teóricos como prácticos sobre el portal GBIF, estructura de base de datos, el estándar Darwin Core (DwC) y la herramienta Integrated Publishing Toolkit (IPT). Todos estos, instrumentos y conocimientos necesarios para hacer la correcta publicación de datos en la plataforma internacional, considerando la calidad y complejidad de estos.

Es un conocimiento tan específico y no fácil de hacer. Es importante que más gente conozca de este lenguaje, que se pueda instruir y que puedan colaborar de sus respectivas colecciones biológicas”, destacó Scarlett Norambuena, ingeniera forestal y asistente del Herbario SQF de la Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas.

Complementando lo anterior y valorando la iniciativa del CDB, Norambuena indicó que “la importancia de publicar estos datos es que quedan disponibles para ser utilizados en investigaciones que pueden escalar incluso a nivel internacional y que pueden servir también para la toma de decisiones para la conservación de la biodiversidad”.

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